溫室氣體管理
1. 溫室氣體盤查
南科管理局持續每年進行溫室氣體盤查，盤查組織邊界分別為臺南園區及高雄園區。園區營運的同時，持續有事業單位進行擴廠，為掌握園區溫室氣體排放，於 2023 年進行 2022 年之盤查，2022 年範疇 1+2 排放量總計為 8,923,342.174 公噸 CO2e，溫室氣體排放強度較 2021 年下降 22.5%;並納入範疇 3 部分項目，範疇 3 排放量為 1,445,675.02 公噸 CO2e。南科管理局積極展開節能輔導措施，同時園區廠商亦進行減碳相關作為，期望能夠減輕環境負擔。
2. 廠商節能輔導
2023 年辦理 6 家園區事業單位節能輔導，輔導推動至今已完成 74 家，依 2023 年實際節能成果調查，累計節電成效約為 10,601.40 萬度，相當於一年減少 52,370.92 公噸 CO2e。
3. 環保相關說明會
為使園區廠商瞭解國家環保管制方向發展趨勢及環保法規管理制度，依照園區特性及廠商需求舉辦 2 場次環保相關之說明會。配合國家 2050 淨零排放路徑中將資源循環零廢棄納入十二項關鍵戰略之一，於 2023 年 7 月 25 日辦理「事業廢棄物資源循環網絡推動暨固體再生燃料應用趨勢說明會」。另因應環境部要求檢測計畫併同許可申請的對象，並鼓勵園區廠商將其所有的廢棄物流向進行管理、查驗和稽核，於 2023 年 10 月 26 日辦理「固定污染源檢測計畫平台系統操作暨廢棄物零掩埋驗證」說明會。
精進規劃
隨著 2021 年召開的第 26 屆聯合國締約方氣候峰會 (COP26)，各締約國之間的「碳排放交易機制」完成制定，也預示著全球淨零競賽正式起跑，而我國亦響應《格拉斯哥氣候公約》，於 2022 年 3 月公告「台灣 2050 淨零排放路徑及策略」，從此以往，減碳及碳稅議題將成為企業營運的顯著衝擊項目之一。南科管理局雖於 2010 年即推動園區廠商節能輔導，然隨著園區及廠商量產規模擴大，整體碳排放量仍逐年呈現上升趨勢，在國內相關法規尚未完備的背景下，管理局僅能持續關注環保法規動態，並透過宣導方式，鼓勵企業投入低碳生產，及早因應未來的法規衝擊。